2018年9月5日，亚太地区教育质量保障组织（APQN）致信评估中心，祝贺我中心获得了APQN理事会的一致认可，将承接2019年—2022年APQN秘书处工作。APQN理事会在信中说：“我们坚信，秘书处落户评估中心后，APQN将会有更大的发展以及更美好的未来。”
在教育部领导以及有关部门的大力支持下，评估中心于2018年6月参与了承接APQN秘书处工作的竞标。经过书面投标和网络视频答辩等环节，APQN理事会一致决定，评估中心在竞争中胜出，将于2019年3月正式接续秘书处工作。
APQN是亚太地区最大的高等教育质量保障国际组织，现有近40个国家和地区的210家会员单位。评估中心作为正式会员单位先后参加了8届APQN质量保障大会,在宣传我国高等教育质量保障成就与经验、推动国家和区域间高等教育质量保障提升方面发挥了重要作用。APQN秘书处负责日常运营、学术交流和财务管理等事务。